附設醫院係奉教育部70.83台(70)高字第27079號函核准
設立，醫學院進行籌備期間，附設醫院亦同時進行籌備，民
國七十五年後醫系第一屆學生進入臨床課程階段，暫借台大
景福會館上課並利用台大醫院實習。七十六年六月附設醫院
落成啟用，所有臨床教職員生南返歸建，並由戴東原擔任首
任院長，七十八年七月戴東原院長辭職，由徐澄清副院長升
任院長。八十一年七月底屆齡退休，八十一年八月黃國恩教
授就任院長，副院長由葉純甫、張傳林、陳志鴻三人繼續擔
任。附設醫院集教學、研究、醫療服務於一體之綜合性醫院
，自八十二年七月一日起獲評鑑通過為「醫學中心」( 前此
項評鑑為「準醫學中心」)。八十八年八月葉純甫教授就任
院長. 由於醫師水準極高、醫療品質良好，已成為雲嘉南高
民眾依賴最深之醫院。

                 二、組    織

    現有三十部、七十八科、十室。

(1)內科部 
   (一般內科、胸腔內科、胃腸肝膽科、心臟血管科、內分泌新陳代謝科、感染病科、血液腫瘤科、

    免疫過敏科、腎臟科、老年科、風濕病科、血液透析室、呼吸治療室、心肺室、內視鏡室),

(2外科部...新版
   (一般外科、胸腔外科心臟血管外科、小兒外科、整形外科、神經外科、直腸外科、外科實驗室)，

(3)泌尿科...新版
   (小兒泌尿科、男性生殖科、泌尿腫瘤科、神經泌尿科)，

(4)耳鼻喉科部
   (耳科、鼻科、喉科、頭頸腫瘤科)， 

(5)皮膚科部
   (一般皮膚科、皮膚病理科、皮膚感染免疫科、皮膚光療科)，

(6)精神科部
   (成人精神科、兒童精神科、老人精神科、社區精神科)，

(7)神經科部 ...新版
   (癲間科、臨床神經生理科、腦血管疾患科、神經心理科、腦波室、肌電圖室)，

(8)麻醉部
   (臨床麻醉科、基礎麻醉科、疼痛科、重症醫學科),

(9)家庭醫學部 ...新版
   (家庭醫學科、社區醫學科、預防保健科、行為科學科)，

(10)眼科部，

(11)骨科部...新版，
    (小兒骨科)
(12)復健部
    (職能治療組、語言治療組、物理治療組、義肢支架製作組)，

(13)婦產部
    (婦科、產科、生殖內分泌科、優生保健科)，

(14)小兒部
    (一般小兒科、新生兒科、小兒神經科、小兒感染科、小兒免疫科、小兒遺傳內分泌科、
     小兒血液腫瘤科、小兒心臟科、小兒胃腸科、小兒腎臟科,兒過敏氣喘免疫科 )，

(15)牙醫部...新版
    (口腔診斷及一般牙科、齒顎矯正科、兒童牙科、補綴及咬合牙科、牙周病科、牙髓病科、
     口腔顎面外科、齒模技工室）,

(16)病理部（解剖病理科、臨床病理科）,

(17)急診部，

(18)門診部,

(19)放射線診斷部 
    (神經放射科、泌尿系放射線科、小兒放射線科、消化系放射線科、超音波室）, 

(20)核子醫學部
    (影像診斷科、放射免疫分析科),

(21)放射線腫瘤部 
    (臨床放射治療科、醫學物理科、放射生物科),

(22)臨床醫學研究部,

(23)加護醫學部,

(24)護理部, 

(25)藥劑部...新版,

(26) 社工部,

(27)營養部，

(28)醫療事務部,

(29)資材供應部,

(30)總務部。


    十室為： 
(1)教材室,
(2)企劃室,
(3)秘書室,
(4)工務室,
(5)資訊室,
(6)人事室,
(7)會計室,
(8)醫學工程室,
(9)病歷室,
(10)勞工安全衛生室。

                 三、營運目標

(1)提供學生臨床教學及實習。
(2)延攬人材建立台灣南部醫療重鎮。
(3)發展成為臨床與基礎結合之醫學研究中心。
(4)培訓各類專科及一般科醫師,以協助醫療院所之發展。
(5)辦理各類醫人員之繼續教育及訓練。
(6)結合各級醫療院所為一完善醫療網,提供民眾完整的醫療照護。
(7)致力於教學、研究、服務三者均衡發展之醫學中心。