本系發展重點可歸納為以下六項

一、配合經濟民生需要，協助進行山崩、土石流、地殼變形、全球定位系統、地下水水位及水質、衛星資訊、區域地質、能源地質和活斷層之調查、量測或防治以及人才培訓。

二、積極配合教育部大學卓越計畫及國科會計畫補助新購之地球化學、礦物學及其他重點儀器，發展基礎地球科學重點研究項目。

三、配合教育部發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫，積極推 本校「地球動力系統研究中心」及「海洋環境及工程研究中心」之推展計劃。

四、配合本校「衛星資訊研究中心」及「防災科技研究中心」之人力及相關儀器設備，發展衛星資訊應用及災害防治之新應用科技領域。

五、積極參與國際海洋鑽探計畫（ODP/IODP）、國際地圈生物圈計畫（IGBP）、國際海洋古全球變遷計畫（IMAGES）及其他地球科學國際合作研究計畫。

六、積極推動與國際知名學術機構簽署研究或教學合作協議，擴展國際學術交流及合作。目前已和日本二十一世紀卓越中心計畫(COE-21program)－岡山大學(Okayama University)地球物質科學研究中心(Institute for Study of theEarth’s Interior)簽定交流協定，建立密切之師生交流及合作關係；也正推動與菲律賓火山與地震研究所之交流合作。