單位分類： 　 上級單位： 　
單位 代表號 上級單位 單位分類
校長室 50006 --- 行政單位
→ 副校長室 50002 校長室 ---
→ 祕書室 50020 校長室 ---
→ 新聞中心 50040 校長室 ---
研究發展處 50900 --- 行政單位
教務處 50100 --- 行政單位
→ 註冊組 50120 教務處 ---
→ 教學資訊組 50150 教務處 ---
→ 學術服務組 50170 教務處 ---
→ 招生組 50190 教務處 ---
→ 體育室 50380 教務處 ---
→ 進修推廣教育中心 51000 教務處 ---
→ 師資培育中心 50147 教務處 ---
→ 聯合分發委員會 51017 教務處 ---
→ 教師發展中心 50200 教務處 ---
→ 雲嘉南教學資源中心 50202 教務處 ---
→ 三創中心 50240 教務處 ---
通識教育中心 50210 --- 行政單位
學務處 50300 --- 行政單位
→ 學生輔導組 50320 學務處 ---
→ 生活輔導組 50340 學務處 ---
→ 課外活動指導組 50360 學務處 ---
→ 衛生保健組 50430 學務處 ---
→ 僑生輔導組 50460 學務處 ---
→ 軍訓室 50700 學務處 ---
→ 生涯發展與就業輔導組 50480 學務處 ---
總務處 50500 --- 行政單位
→ 文書組 50520 總務處 ---
→ 事務組 50540 總務處 ---
→ 資產管理組 50580 總務處 ---
→ 出納組 50600 總務處 ---
→ 營繕組 50620 總務處 ---
→ 駐衛警察隊 66666 總務處 ---
→ 採購組 50570 總務處 ---
會計室 50800 --- 行政單位
人事室 50850 --- 行政單位
圖書館 65700 --- 行政單位
→ 採編組 65710 圖書館 ---
→ 期刊組 65732 圖書館 ---
→ 典藏組 65750 圖書館 ---
→ 閱覽組 65760 圖書館 ---
→ 系統管理 65773 圖書館 ---
→ 多媒體組 65790 圖書館 ---
→ 資服組 65780 圖書館 ---
計算機與網路中心 61000 --- 行政單位
藝術中心 50014 --- 行政單位
法律顧問室 50510 --- 行政單位
生物科技中心 31104 --- 行政單位
微奈米科技中心 31380 --- 行政單位
國際學術處 50950 --- 行政單位
→ 國際合作組 50960 國際學術處 ---
→ 國際學生事務組 50990 國際學術處 ---
博物館 63020 --- 行政單位
邁向頂尖大學計劃推動總中心 51057 --- 行政單位